1、信用不同。银行保函是由银行直接出具的，属于银行信用，而商业保函是由专业的担保机构或商业机构出具的，属于商业信用。

　　2、用途不同。银行保函多用于国际贸易，国内会比较少，属于国际担保业务，而商业保函多用于国内国家。

　　3、商业保函相对于银行保函要简单上许多，其不需要准备太多的资料，而且办理速度快，费用也比较低。

　　4、商业保函的格式条款相对于会灵活一些，而银行保函的格式就会比较严谨，不能随意更改。